所有作者:彭金华 张硕 杜梅泽 邓科君 张勇
作者单位:电子科技大学生命科学与技术学院
论文摘要:本研究以丹参实验材料,基于植物S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶基因序列设计兼并引物,综合应用同源克隆、RACE及Tail-PCR技术,分离得到1个新的植物SAMDC基因家族成员,命名为SmSAMDC(GU983041)SmSAMDC基因cDNA序列全长1650bp,存在3个植物SAMDC 基因特征ORF(tiny ORF、small ORF及main ORF);SmSAMDC基因组序列全长3059bp,存 在3个保守内含子,所有外显子、内含子连接边界序列符合“GT-AG”剪接规则。SmSAMDC基因main ORF编码蛋白质理论分子量为39。4 kD,pI为4。71,均与植物SAMDC酶原蛋白相近。二级结构预测发现,SmSAMDC基因main ORF编码序列中:25。28%的氨基酸残基构成α螺旋(hlpha helix)、24。17%的氨基酸残基构成延伸链(extended strand)、50。56%的氨基酸残基构成随机卷曲(random coil)。氨基酸序列比对分析结果表明,SmSAMDC与已知植物SAMDC 基因家族成员高度同源,具有植物SAMDC基因家族的酶原剪切位点及SAMDC蛋白快速降解相关PEST保守结构域。
关键词: 丹参 多胺 S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶 基因克隆
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