所有作者：贺道华 邢宏宜 赵艳宁 齐程 王艳婷
作者单位：西北农林科技大学农学院
论文摘要：关联分析是利用连锁不平衡(linkage disequilibrium， LD)检测自然群体中影响表型的基因位点及其等位变异的方法，而材料的基因组血统与分子亲缘关系的推测则是关联分析和提高育种效率的基础。本研究利用均匀分布于２６条染色体上的１３２个SSR标记， 对经挑选的９２份栽培棉材料的基因组变异进行扫描， 利用混合模型分析该群体的遗传结构。当指定７个亚群时（K=７），似然值达到最大，该群体分为亚洲棉组(Cluster ５)、海岛棉组(Cluster ７)、陆地棉１组-３组(Cluster ２、Cluster ４和Cluster ６)、混合血统组(Cluster １和Cluster ３)。组群间的Kullback-Leibler和Q值矩阵显示了７个组群的遗传组成和材料间的分子亲缘关系。采用TASSEL软件的GLM (general linear model)方法对５个品质性状２年×３重复的观测值进行标记与性状的关联分析，结果表明：该群体中累计有２１个位点与性状相关，一些标记同时与２个或多个性状相关联， 可能是性状相关乃至一因多效的遗传基础。本研究将为育种材料的利用、标记辅助选择及下一步候选基因关联作图提供参考信息。
关键词： 棉花 SSR 群体结构 关联分析
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