所有作者：隋承萍 张启坤 徐根明 丁先锋
作者单位：浙江理工大学生物工程研究所
论文摘要：芯片技术已经开始应用到全基因组范围分析非编码RNA的表达。在RNA的研究方法上，许多研究者将长的RNA进行片段化处理，因为这些长的RNA所具有的复杂的二级以及三级结构能够显著降低它们被探针捕获的效率，或者很难与固定在芯片表面的探针互补配对，从而影响芯片的质量。然而这一方法是否能够应用到具有同样复杂结构的非编码RNA的研究上还有待探究。这里以核糖体开关RNA和总RNA为研究对象，用５×片段化Buffer（pH ８。４）对上述RNA进行片段化处理，同时，用T４多核苷酸激酶将片段化后的RNA进行３’端去磷酸化处理。最后，经过处理后的RNA片段分别用Cy３和Cy５标记，并用微流体芯片检测标记好的RNA样品。另外，对总RNA进行去核糖体RNA处理，以此来判断大量存在的核糖体RNA对芯片检测结果的影响。结果发现，RNA样品经过片段化、去磷酸化的处理后，芯片检测的信号明显比不做处理的好；去除核糖体的处理效果不是太显著。
关键词： 微流体芯片 片段化 去磷酸化 非编码RNA
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